《分子共和国》的出版是一次勇敢的尝试。徐光宪先生(他可是获得了国家最高科学技术奖的大师哟)挥笔写下了本书的“开国大典”，而书中内容都来自他和师生们的创作。从“单质一族”的氢气、氧气，到“无机城市”的硫酸、硝酸、二氧化碳，再到“有机堡垒”、“铁匠铺”……师生们以丰富的想象力构建了一个生动而真实的“分子共和国”。他们所特有的学术敏锐，独特的观察视角，清新活泼的语言，加上良好的化学基础，构成了这组科普文章引人入胜的要素。
《分子共和国》所包含的内容不仅仅是科普文章，同时也汇集了北京大学化学与分子工程学院教育成果的结晶。素质教育，全面发展，让学生们学以致用，把化学带回生活，在生活中思考化学，相辅相成，相互促进，这是学院一贯的思路。
“分子共和国中的事，几乎没有我不知道的。”四面体分子得意地说道。
“没用的，”硫酸分子转过身去，“就算你通晓天下，也不会知道我与水之问的事的，也不会解开我心中的矛盾。”
“居然又是水那小妮子，她仍然不知悔改吗？”四面体分子忽然大声地说道。
硫酸猛地转过身：“什么，你说什么？什么不知悔改？”
四面体分子哼了一声，说道：“当年她一族分子化作氢离子与氢氧根离子，同时以强酸、强碱大闹天下，才被下了氢氧离子积禁制，也算是罪有应得。可叹她还不知悔改，四处骗取氢离子与氢氧根离子，哈哈！真是生性风流啊！”
“你怎知她是骗取？”硫酸不服地争道，忽然又问：“什么是氢氧离子积禁制？”
“你不知道她本身可以释放出氢离子与氢氧根离子吗？禁制的内容就是她的氢离子与氢氧根离子的浓度乘积要比她本身的浓度小一百万亿倍。可惜当时禁制定制得不完善，让她发现了升高温度可以削弱禁制。还好，不久后禁制得到弥补，定下了常压下373K温度时水必须沸腾，而气态水分子是无法利用那两个离子的。哼！江山易改，本性难移。早就听说现在水在四处骗取氢离子与氢氧根离子，现在看果然是真的！”
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